藏红花的药用价值奇特，尤其以活血养血而闻名天下。据《本草纲目》记载，藏红花能“活血、主心气忧郁，又治惊悸”。藏红花具有疏经活络、通经化淤、散淤开结、消肿止痛、凉血解毒、忧思郁结，长期坚持服用可收到令人心喜，全面提高人体的免疫力的功效。现代药理研究证明它对改善心肌供血供氧等方面疗效确切，藏红花含有多种甙的成分，多种甙可明显增加大冠状动脉的血流量。
    近年来，科学家发现藏红花的花蕊中含有的藏红花酸（Crocitin）、藏红花(safranal)、藏红花素(Crocin)和藏红花苦素(Protocrocin)等都具有较强的抗癌活性。特别对于血癌细胞、乳头癌、扁平细胞瘤和软组织肉瘤等都具有较强的抑制作用。其抗癌机制是抑制癌细胞的DNA和RNA合成，抑制细胞蛋白激酶的活性和原癌基因的表达，抑制苯并芘和12-O-14酰基磷酮-13乙酸盐（TPA）等致癌物质的毒性，从分子水平抑制肿瘤的形成。其癌细胞的半致死量为0.8～2muM，毒性远远小于维甲酸，因此，藏红花素等抗癌活性物质将成为21世纪最理想的抗癌药物之一。
藏红花独特的神奇功效，被中外医学界广泛应用以预防和治疗脑血栓，脉管炎、心肌梗塞、血亏体虚、月经不调、产后淤血、周身疼痛、跌打损伤、神经衰弱、惊悸癫狂等疾病。藏红花具有活血、化瘀、消炎止痛作用，它还具有镇静作用，消除神经不适，提高人身体免疫力。藏红花还是妇科良药，改善经血不调等疾病。

[选方]
①治各种痞结：藏红花每服一朵，冲汤下。忌食油荤、盐，宜食淡粥。（《纲目拾遗》）
②治伤寒发狂，惊怖恍惚：撒法即二分，水一盏，浸一宿服之。（《医林集要》）
③治吐血：藏红花一朵，无灰酒一盏。将花入酒内，隔汤炖出汁服之。（《纲目拾遗》）